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국내에서 발견한 생물종의 수는 동물 26,575종, 식물 5,349종, 균류 4,686종, 원생생물 7,316종, 원핵생물 1,369종이 있습니다. 같은 종 안에서도 유전자들의 다양함이 있어야 생물의 멸종을 막을 수 있으며 이는 동물 뿐 아니라 식물에도 적용이 됩니다. 유럽의 산림은 적은 수의 종으로 이루어져 있는데 모두 나무의 높이가 높아서 아래쪽에서 다른 식물들이 자라기 어려우며 사슴이나 토끼같은 동물을 찾아보기 어렵습니다.
척추 동물에는 조류, 파충류, 어류, 양서류, 포유류가 있습니다. 무척추동물에는 절지동물, 강장동물, 연체동물, 환형동물, 극피동물이 있습니다. 조류에는 부엉이, 두루미가 있고 파충류에는 악어, 거북, 도마뱀이 있습니다. 어류에는 잉어, 붕어, 열목어가 있고 양서류에는 두꺼비, 맹꽁이, 도롱뇽이 있습니다.
절지동물에는 곤충류, 갑각류, 다족류, 거미류가 있습니다. 강장동물 종류에는 산호, 말미잘, 해파리가 있고 환형동물에는 지렁이, 거머리, 갯지렁이가 있습니다. 연체동물에는 달팽이, 굴, 조개, 문어, 오징어가 있고 극피동물에는 성게, 불가사리, 해삼이 있습니다.
식물은 속씨식물, 겉씨식물, 선태식물, 양치식물로 나뉩니다. 꽃이 피는 식물은 거의 속씨식물이며 겉씨식물로는 소나무 등 구과식물문, 마황문, 은행나무문, 소철문 등이 있습니다. 선태식물에는 솔이끼문, 우산이끼문, 뿔이끼문이 있고, 양치식물에는 고사리 등 양치식물문, 석송문이 있습니다.
원생생물계에는 미역, 김, 다시마, 해캄 등의 황적/녹/갈/홍/규조류가 있으며 짚신벌레, 아메바, 유글레나, 반달말 같은 원생동물도 있습니다. 원핵생물계에는 염주말 등 남조류, 세균이 있습니다. 균계에는 곰팡이, 효모, 버섯 등이 있고 세포가 아닌 것으로는 바이러스가 존재합니다.
대표적인 침입 외래생물로 꽃매미, 돼지풀, 가시박, 뉴트리아, 큰입배쓰, 붉은귀거북이 있습니다. 개발 등으로 생태계가 망가진 지역에는 외래생물이 잘 정착합니다. 경쟁자나 천적이 없어서 기하급수적으로 그 숫자가 늘어나서 골칫덩이입니다. 알레르기를 일으키거나 병원균을 옮겨다니기도 하고 생태계의 질서를 흐트려놓습니다.